新中国成立以来，我国青藏高原科学考察研究也经历了半个世纪的历程。经过几代人努力奋斗，青藏高原科学研究取得了举世瞩目的成就，锻炼与造就了一支高水平的科学研究队伍。青藏高原号称地球第三极，在地学、生物学和资源环境科学研究中占有独特地位。因此，对青藏高原地区的科学研究不论是对我国还是对于全人类将是一个永恒的研究课题，这种研究工作需要不断延续，不断深化，不断有新的科学发现。为了使老一辈科学家所开创的青藏高原科学考察研究事业后继有人，吸引一代又一代更多的年青科学工作者投身到这一事业中来，为鼓励我国广大青年科技工作者,献身于青藏高原地区社会经济进步和科技发展事业,促进青藏高原科技人才的成长，中国青藏高原研究会于1995年特决定设立“青藏高原青年科技奖”，此奖项为社会力量设立的面向全国科学技术奖。
本奖励旨在表彰思想进步、学风良好，在青藏高原科技工作中做出突出贡献的，年龄在40周岁以下的中国青年科技工作者青年科技工作者，以鼓励青年科技工作者奋发进取，献身于青藏高原科技事业，促进青藏高原科技人才的成长。
本奖励的设立由中国青藏高原研究会经理事会讨论决定，并相应制定了该奖的评定条例和细则，根据条例每两年评奖一次。该奖项设立评审委员会，孙鸿烈院士任主任，委员有郑度院士、李文华院士、孙九林院士、李廷栋院士、丁国瑜院士、滕吉文院士、肖序常院士、姚檀栋研究员、刘纪远研究员、格勒研究员、潘懋教授、何希吾研究员等。评审委员会将评选结果报常务理事会审批。对获奖者除颁发奖励证书外，并发奖金。奖金由原“中国青藏高原青年科技奖”奖励基金中支付。
1996年4月在北京翔云楼宾馆举行首届获奖者颁奖仪式，获奖者有：
丁 林、方小敏、王保海、刘晓东、刘燕华、
张春光、姚檀栋、高 锐、彭 敏、廖俊国
1998年在北京西藏大厦举行第二届获奖者颁奖仪式，获奖者有：
王洁民 、边巴扎西(藏)、刘宏兵、朱立平、李世杰、
李忠勤、 成升魁、 罗 辉、姚培毅、潘保田
2001年在北京西藏大厦举行第三届获奖者颁奖仪式，获奖者有：
王宁练、包维楷、伍永秋、刘 焰、朱同兴、
吴敬禄、张宪洲、张登山、李英年、赖绍聪
2003年在北京鸿翔大厦举行第四届获奖者颁奖仪式，获奖者有：
尼玛卓玛(藏)、孙 航、吴 宁、姬秋梅(藏)、谭捍东、
马玉寿、 许力生、李升峰、贾永忠、郭正堂
2005年在广西桂林桂山大酒店举行第五届获奖者颁奖仪式，获奖者有：
边多(藏)、陈世龙、陈正乐、李海兵、雷富民、
尚彦军、 唐红玉、鹿化煜、徐柏青、熊 熊
2007年在新疆喀什环球金座宾馆举行第六届获奖者颁奖仪式，获奖者有：
刘喜方、石培礼、田立德、其美多吉（藏）、赵志丹
